知网查重系统识别引用的原理主要基于文献引用关系的分析。当用户提交论文后，系统会对文中的引用部分进行提取，并与知网数据库中的文献进行比对。系统会通过比对文献的相似度、引用格式等信息来判断是否存在引用关系。同时，系统还会利用文献中的引用标识、引用内容等特征进行识别。

此外，知网查重系统还会通过比对文献的内容、作者、出版时间等信息来进一步确认引用关系。系统会综合考虑多个因素，如引用文献的可信度、引用格式的规范性等，从而确保对引用关系的准确识别。通过这些方法，知网查重系统能够有效识别引用，提高论文查重的准确性和可靠性。